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248 thoughts on “R/Bioconductor”

Dominic说道：

2016-09-24 6:03 上午

博主你好，现在在学习您的教程，求bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”的密码，谢谢！

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1. admin说道：
  
  2016-09-28 1:06 下午
  
  已发送，请查收。
  
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  1. BerlinWoods说道：
    
    2019-07-22 3:13 上午
    
    博主你好，现在在学习您的教程，求bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”的密码，谢谢！
    
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    1. admin说道：
      
      2019-10-10 9:23 上午
      
      已发送，请查收。
      
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Kevin Lee说道：

2016-10-06 3:55 上午

Please give me the password “bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”, thanks to ur kindness help!

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1. admin说道：
  
  2016-10-10 1:17 下午
  
  已发送，请查收。
  
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韩伟说道：

2016-10-21 4:39 上午

欧老师，您好，我一直在参考您参与著作的“R语言与Bioconductor生物信息学应用”，现在一直有一个问题没有解决：多个探针组对应一个基因时，我可以通过什么函数或者package解决取多个探针组表达值均值的问题。书中提供的方案是下载其它研究机构合并好的CDF、probe文档（链接已经失效），但我无法通过此途径解决。只能希求您的帮助。谢谢。

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1. admin说道：
  
  2016-10-24 11:43 上午
  
  合并好的CDF文件其实并不是研究的主流。你还是使用正常的CDF文件，做完以后，依照探针组的类别（http://www.affymetrix.com/support/help/faqs/mouse_430/faq_8.jsp）进行筛选比较合适。
  
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amrino说道：

2017-02-16 2:32 上午

博主你好，现在在学习您的教程，求bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”的密码，谢谢！

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1. admin说道：
  
  2017-02-16 7:35 上午
  
  已发送，请查收。
  
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Maxerlei说道：

2017-02-18 6:28 上午

你好，我也在学习芯片处理，也想要全自动处理基因芯片的密码，谢谢！

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1. admin说道：
  
  2017-02-19 10:09 上午
  
  已发送，请查收。
  
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imoyaki说道：

2017-03-05 7:06 上午

也求博主分享全自动处理基因芯片的密码！在此表示万分感谢！个人觉得应该对自己的水平提高有所帮助！

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1. admin说道：
  
  2017-03-05 2:17 下午
  
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王冶说道：

2017-04-09 2:29 下午

老师您好，我是一名刚刚毕业的临床研究生，我叫王冶，最近我按照limma说明书做差异分析遇到一个问题，当我输入命令fit2<-ebays（fit1）后，弹出警告Zero sample variances detected, have been offset away from zero。随后继续输入toptable依然会得出差异基因。我不明白是哪里出了问题。请老师帮我解释为什么会有警告和警告的意思。

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1. admin说道：
  
  2017-04-13 1:40 下午
  
  这只是告诉你至少有一个gene它的表达值在所有的样品中没有任何变化，这个gene会在计算中被忽略.
  
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黎海霞说道：

2017-04-26 7:29 下午

也求博主分享全自动处理基因芯片的密码！正在做基因芯片分析，十分感谢

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1. admin说道：
  
  2017-05-03 8:33 上午
  
  已发送，请查收。
  
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尔霖说道：

2017-07-04 8:30 上午

博主你好，现在也是正在学习您的教程，收获颇多，求bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”的密码，谢谢！

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1. admin说道：
  
  2017-07-06 9:20 上午
  
  已发送，请查收。
  
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阿飞说道：

2017-07-21 2:10 上午

老师您好，在您的文章中收获良多，希望有空的时候能一份给全自动处理基因芯片的密码，谢谢您

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1. admin说道：
  
  2017-07-21 8:44 上午
  
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Rornot说道：

2017-11-10 12:58 下午

博主您好，请问“bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件R程序”文章的密码是？另外对于Bioinformatics初学者，分析基因表达microarray和RNA-Seq数据，有没有R实用性书籍推荐呢？大部分时间精力集中在试验台上，需要用到R做一些分析的时候感觉无从下手。。。当然您的博客很有帮助

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1. admin说道：
  
  2017-11-10 1:32 下午
  
  已发送，请查收。
  
  感谢您的鼓励。您客气了。在中文书籍中，我还真是很保留自己的意见。真的想学的话，最好的办法就是自己有活要做，然后在我的博客中找到相应的文章中提的软件包，去读这些软件包的说明文档。这是我个人的学习经验，不一定适合每一个人，但是我以为是最好的办法了。
  
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puke说道：

2017-11-27 12:32 上午

博主你好，现在在学习您的教程，求bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件”的密码，谢谢！

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1. admin说道：
  
  2017-11-28 11:11 上午
  
  已发送，请查收。
  
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wangxuanyi说道：

2018-01-20 12:47 上午

正在学习怎么处理微阵列数据。看到老师的教程，请老师分享全自动处理基因芯片的密码！万分感谢

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1. admin说道：
  
  2018-01-22 12:50 下午
  
  已发送，请查收
  
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wangxuanyi说道：

2018-01-23 10:12 上午

收到了，谢谢老师

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Li Shuangyan说道：

2018-12-10 2:55 上午

R语言与Bioconductor生物信息学应用这本书中有些函数被弃用了，不知道到哪里去找代替的函数，例如计算每个模板对Hsapiens$chr22匹配的个数时用的函数countIndex()就显示Error in countIndex(vindex) : could not find function “countIndex”，想请问如何解决

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1. admin说道：
  
  2019-01-02 12:38 下午
  
  可以参见countPattern。
  
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Yiqiang Huang说道：

2018-12-25 11:39 上午

博主您好！正在按您的博文学习，希望您分享 bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件R程序密码，非常感谢！！

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1. admin说道：
  
  2019-01-02 12:36 下午
  
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chengyan说道：

2019-01-03 9:18 下午

欧老师您好，我想求一下自动处理芯片文章的密码，谢谢您辛苦的努力！

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1. admin说道：
  
  2019-01-10 9:05 下午
  
  已发送，请查收。
  
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yan cheng说道：

2019-01-03 9:32 下午

谢谢欧老师分享的精彩课程，让我受益匪浅。我基本没有计算机基础，买了一堆书，看了两本，算是初步了解的R的运行。但是到了bioconductor的应用时，还是一头雾水。学习一门计算机语言还真是困难啊。我看到了自动获取CEL文件的文章，需要密码，肯定欧老师百忙之中，发送一份给我，不胜感激。

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1. admin说道：
  
  2019-01-10 9:04 下午
  
  已发送，请查收。
  
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雷常贵说道：

2019-04-28 10:21 下午

老师你好，我想问一下关于bioconductor全自动处理基因芯片CEL文件R程序，这个的密码，麻烦你可以给我看看，想学习学习，十分感谢您。

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1. admin说道：
  
  2019-05-01 12:39 下午
  
  已发送，请查收。
  
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  1. 雷常贵说道：
    
    2019-05-04 8:45 下午
    
    发送到我的邮箱了？老师，我咋没收到啊？可以麻烦再发一次么？
    
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    1. admin说道：
      
      2019-05-21 10:17 上午
      
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陆晟说道：

2019-09-22 12:48 下午

老师您好！bioconductor全自动处理那一篇的密码能告诉我嘛？谢谢您！！我还想请问下pd.huex.1.0.st.v2 和pd.huex.1.0.st.v1的区别是什么？我用oligo包的时候发现不能下载pd.huex.1.0.st.v1，我可以用pd.huex.1.0.st.v2 来代替么？万分感谢！！

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1. admin说道：
  
  2019-10-10 9:20 上午
  
  好久不作了。我也不十分清楚。搜了一下，https://www.biostars.org/p/320598/
  
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