把以前用shiny做的小工具整理了一下，
汉字描红本
» 自动生成汉字描红本的在线工具
工具可以自动生成田字格，汉字描红本。田字格可设置每行字数。 描红字多种繁简字体可选，描红颜色可以按喜好设置，包括透明色。预设文本包括随机诗（千家诗）词（全宋词+全唐五代词），美洲华语一至九册生字。 可以自动生成拼音，准确率不断提高中。
随机算数题
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标签：软件
软件与网络应用
构建miso annotation
step1. 安装软件rnaseqlib.
pip install –upgrade pip
pip install git+https://github.com/yarden/rnaseqlib.git
pip install gffutils
step2. 从UCSC下载ensGene.txt, knownGene.txt, refGene.txt到一个目录中，比如http:[……]
如何使用bioconductor docker来debug程序中的错误
在package的维护过程中，我们常常遇到的一个困难就是无法重复bioconductor build系统中的错误。有些时候我们想方设法把系统做得和bioconductor build系统做得一致，但是过了几个月，因为疏于维护，或者每日更新过于麻烦，有些时候就无法重复bioconductor build中的错误了。
在这个时候，我们可以利用bioconductor docker来对自己的pac[……]
随机算数题
RNA-seq差异表达分析工作流程-2
参考文献：
1. Pertea M, Pertea GM, Antonescu CM, Chang TC, Mendell JT & Salzberg SL. StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA-seq reads Nature Biotechnology 2015, doi:10.1038/[……]
在R3.3中安装Bioconductor最新安装包
如果你是一名开发人员，你会发现，当你使用R3.3时，bioconductor不能使用biocLite自动更新了，它会显示不支持R3.3。
这是因为通过source(“http:bioconductor.org/biocLite.R”)安装的BiocInstaller不是最新版本的缘故。
所以通过安装最新的BiocInstaller就可以解决问题了。
tmp[......]<p class="read-more"><a href="http://qiubio.com/archives/4093">继续阅读</a></p> |
cbioportal的CGDS-R库使用介绍
tophat library type 应该怎么设置
当我们拿到一个测序结果，实验人员也搞不清楚他的结果的library type怎么运行tophat呢？
依照手册，你可以先访问实验人员，他使用的是什么样的测序手段，是用的illumina还是SOLiD。如果是SOLiD，多半是second strand. 如果是illumina，可能还是分辨一下，主要是分辨unstraned还是firststrand.
这可能需要分三步走：
1 r[……]
bioconductor开发指导
youtube上的，所以，需要翻墙。全英文…[……]
slide of BioC 2014 flashlight talk for motifStack
去参加了BioC2014，在开发者会上讲了一下motifStack。
今天把PPT整理了一下，发上来宣传一下。
motifStack, A tool for graphic representation of multiple motifs[……]