Bioc2019 workshop学习笔记 (1)

题记:Bioc2019在上周结束了。纽约回来之后,感觉收获很多很杂,于是打算一步一步温习一遍会上学到的东西。

 

使用docker来实现学习环境

第一步,安装docker

第二步,pull seandavi/bioc_2019。这个docker中包含了所有的依赖环境,以及rstudio server。

docker pull seandavi/bioc_2019

第三步,在本地新建一个文件夹,比[……]

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使用travis-ci来测试R/Bioconductor包

travis-ci.com是一个非常流行的软件测试网站。它会自动检测你在github上软件包的变动而进行编译测试,你可以在readme文档中加入测试结果是否passing的图像,非常方便。但是,也可能会出很多bug,因为它会涉汲多方面的环境,测试出错不一定是自己的软件包出现了问题。

第一步,在travis-ci.com上使用你的github帐号注册一个用户。

第二步,在github中选择你希望[……]

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