生物信息学生R入门教程–绘图基础 2

本教程版权为《糗世界》所有,任何组织或个人不得未经书面许可转载。 在阅读本节前请自测,如果全部都知道正确答案, ...

生物信息学生R入门教程–R编程 3

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如何得到exon numbering 2

如何得到exon numbering
以前,NCBI的genomic browser中是可以得到一个所谓的exon number的。其规则为同一个基 ...

使用R绘制带比例的饼图 Pie Chart with Annotated Percentages 1

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pie1 <- function (x, labels = names(x), ...

使用Rcurl提交表单 2

有时候需要向在线工具批量提交申请。手动操作非常繁琐,使用curl工具提交会非常方便。 Rcurl已经整合好了相 ...

使用R按照指定宽度计算覆盖率(calculate coverage by bins)

如何使用R来按照bin(比如说每200碱基宽)来计数覆盖度并生成一个bedgraph文件呢? 这个其实就是所谓 ...

每天更新R原码 svn R source

在一个特定的目录下,每天checkout开发版的R,并且完成安装,应该怎么做呢? cd path/to/put ...

理解edgeR

from: edgeR: a Bioconductor package for differential ex ...

使用DEXSeq分析NGS数据中的exon表达差异 12

对于RNA-seq,除了gene水平的差异分析外,还可以进行exon水平的差异分析。这时可以使用Biocond ...

GO/KEGG富集分析enrichment analysis 92

本教程使用GOstats来对给定的基因symbols做富集分析。 > library(" ...