关于GenomicRanges::GRanges的几点

这是Bioc2015的学习笔记。 对于GRanges基础的部分我就跳过了。心得以下几点 # 如何改变seqna ...

tophat library type 应该怎么设置 17

当我们拿到一个测序结果,实验人员也搞不清楚他的结果的library type怎么运行tophat呢? 依照手册 ...

如何使boxplot的宽度窄一些

如何使boxplot的宽度窄一些
很多时候我们都会遇到这样的情况,那就是使用boxplot对list画图的时候,它的box的宽度无法调整。我看到 ...

ChIP-Seq 数据分析 18

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markdownR plugin for wordpress 2

markdownR plugin for wordpress
花了两天的时间,写了一个可以直接在wordpress上写Rmd,然后自动转换成博文,回头编辑的时候还可以对原有 ...

MacOS compile R error: dyld: Symbol not found: _libiconv_open

First, compile libiconv from source and install it in a ...

在rmd文件中自动改变图片的长度或者宽度

在rmd文件中自动改变图片的长度或者宽度
最近不太会起标题了,总是起的很长。 问题:当我们在写Rmd文件时,有时候会在一个loop循环里,或者各种app ...

如何使用R将DAVID功能分析中的function annotation cluster结果2D图合并显示 21

如何使用R将DAVID功能分析中的function annotation cluster结果2D图合并显示
标题太长了,我实在是无奈:) 首先是数据生成,先去DAVID网站Start Analysis 下点选Demol ...

使用Biostrings的PDict搜索一系列小片段 4

今天遇到一个小问题,在给定的一些序列中,搜索CRISPR Toolbox中GeCKO library中已有的g ...

如何使用biomaRt做hg19注释

因为现在ensembl已经更新了human的注释库,所以当你直接使用 library("bi ...