关于map当中的unique mapped reads问题 18

当我们使用bwa或者bowtie map reads之后,当我们察看日志文件,我们会看到诸如: 2016411 ...

在R中肩并肩(side-by-side)绘制箱线图(box-plot)

在R中肩并肩(side-by-side)绘制箱线图(box-plot)
这里分为两部分,第一,肩并肩绘制图型,第二,对于有显著差异的相邻的数据标记星号。 > a<-mat ...

使用R从网页中提取表格 1

有时候我们在数据挖掘的过程中需要提取网页中的表格。我们可以使用下面的代码: > library( ...

从org.Xx.eg.db包中提取基因起止位置(本文已被历史淘汰,请使用TxDb包)

基因往往会有多个转录子版本,所以基因的起止位置并不一定。这里给出的示例代码用于演示如何从org.db包中提取出 ...

R当中的circos——OmicCircos 10

R当中的circos——OmicCircos
R也可以画出类似circos的图了,这是最新的OmicCircos给我们带来的新功能。 OmicCircos与 ...

使用BiomaRt获得在线注释信息 17

使用BiomaRt获得在线注释信息
完整的生物信息学分析步骤往往会包含注释工作。在Bioconductor中,最方便的办法是使用注释包。注释资源除 ...

Bioconductor软件包下载统计

bioconductor有它自己的统计,在http://bioconductor.org/packages/s ...

多版本R并存

多版本R并存
如果你现在安装了R 3.0.1,你还需要安装R development version的时候,应该怎么做呢? ...

使用biocLite从原文件安装

一句代码: biocLite("packageName", type="source")

为R/Bioconductor开发调整RStudio 1

为R/Bioconductor开发调整RStudio
RStudio默认的是R。但是在很多情况下,我们需要使用到R-dev的这样的开发版本,应该怎么办呢?本文就讲解 ...