理解edgeR

from: edgeR: a Bioconductor package for differential ex ...

使用DEXSeq分析NGS数据中的exon表达差异 10

对于RNA-seq,除了gene水平的差异分析外,还可以进行exon水平的差异分析。这时可以使用Biocond ...

GO/KEGG富集分析enrichment analysis 92

本教程使用GOstats来对给定的基因symbols做富集分析。 > library(" ...

R的内存管理 6

当大数据量到来的时候,使用R分析会显得力不从心,最主要的问题在于内存。因为在大多数情况下,R需要将数据全部读入 ...

GATK练习题 14

GATK练习题
因为本教程年代有些久远,无法保证其正确性,只是用于交流讨论。 教程适用于GATK v4, release 2. ...

使用TranscriptDb获取所有的exons以及introns 2

> library(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene) ...

几个关于癌症基因的数据库(TCGA) 3

突变数据: http://www.tumorportal.org/ 癌基因相关: Cancer Gene Ce ...

how to install SortMeRNA on mac os x 10.8.5 2

I download SortMeRNA from http://bioinfo.lifl.fr/RNA/so ...

R为什么认为它们不相等 3

R为什么认为它们不相等
在最近的编程过程中遇到一个小问题: > floor(29/50*50) [1&# ...

如何使用bioconductor做liftover 2

当我们有不同版本的bed文件,比如说有的bed文件map到hg18, 有的bed文件map到hg19,或者对于 ...