bioconductor系列教程之一分析基因芯片上 49

bioconductor系列教程之一分析基因芯片上
我们先用一个图来描述一下基因芯片(通常指Affymetrix microarray chips)实验的流程。 ...

在blast中E值(E value)是什么?

一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们 ...

用perl实现细菌蛋白质定位预测批处理

用perl实现细菌蛋白质定位预测批处理
首先声明,这里并不是我用perl来写个算法。如果需要算法相关的东西,得去看文献。 这里,其实只是借对格兰氏阳性 ...

GO数据库学习笔记(4)

上一次学习了什么DAGs,这次我想实践一下学习的东西。 题目:对于任意给出的属于某属的多个基因,用树状图表示这 ...

GO数据库学习笔记(3)

GO数据库学习笔记(3)
为了搞清楚gene ontology database的数据结构,必须得先了解清楚一个概念,什么是Direct ...

GO数据库学习笔记(2)

这次要对数据进行处理了。原代码如下: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 ...

GO数据库学习笔记(1)

GO数据库学习笔记(1)
前几天学习了KEGG API之后,感觉这个数据虽然好,但是还是有些局限性,比如它比较重视代谢途径而会遗漏其它信 ...

KEGG API学习笔记(3)

今天接着昨天的任务继续。昨天已经实现了文件读取了表达差异基因的筛选工作,今天的任务就是把这些基因在代谢途径中显 ...

KEGG API学习笔记(2)

既然已经可以从利用API成功调取数据了,我们应该开始自己的学习过程了。据以前的体会,学习一门语言,必须带着问题 ...

KEGG API学习笔记(1)

我写这个东西,就是为了给自己一个激励,防止自己半途而废。KEGG(Kyoto Encyclopedia of ...