RNA-seq差异表达分析工作流程-2 11

参考文献: 1. Pertea M, Pertea GM, Antonescu CM, Chang TC, M ...

再论热图 (heatmap) 3

“`{r echo=FALSE,warning=FALSE,message=FALSE} libr ...

Rsamtools基础知识问答 4

在次世代测序结果中,我们经常需要对bam/sam文件进行操作。在命令行中,我们很习惯使用samtools来操作 ...

变更Rcpp的compiler

有时候我们在安装c++的R包时需要使用g++。但是有时候系统自带的g++版本太低,你自己安装一其它的高版本的g ...

IUPAC strings to pcm

需要把IUPAC字符串形式的motif转换成position count matrix “`{r} ...

在R3.3中安装Bioconductor最新安装包 4

如果你是一名开发人员,你会发现,当你使用R3.3时,bioconductor不能使用biocLite自动更新了 ...

cbioportal的CGDS-R库使用介绍

今天要介绍的这个包是[cBio Cancer Genomics Portal](http://www.cbio ...

RLElist to GRanges

“`{r} library(GenomicRanges) example(GRanges) myc ...

magrittr – Ceci n’est pas un pipe. 2

magrittr - Ceci n'est pas un pipe.
没文化真可怕。之前写[R中的pipelining(chaining)概念](/archives/3965)的时 ...

关于GenomicRanges::GRanges的几点

这是Bioc2015的学习笔记。 对于GRanges基础的部分我就跳过了。心得以下几点 # 如何改变seqna ...