如何从SRA文件中分离出从对短序paired-end reads 5

很多时候我们从NCBI的SRA文档中分离paired-end sequencing数据。但是当我们使用SRA ...

microRNA deep-sequencing数据分析手段 27

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什么是microRNA呢?MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中长约20-22个碱基的对基因表达起负 ...

如何在CentOS6下安装R(how to install R in CentOS6.2)

首先安装一个源,EPEL(Extra Packages for Enterprise Linux),这个是杜克 ...

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接到学习任务,要求搞清楚两个R包,edgeR和REDseq。这一篇就主要讲述edgeR中的案例之一,对应edg ...

MAC OSX中找寻失落的ZIP解压文件

在解压一个比较大的文件的时候(大于4GB的zip),使用unzip,结果显示 Archive: {my fil ...

在R中遇到Warning: unable to access index for repository 2

使用 chooseCRANmirror() 再选一个新的即可。

R安装遇到的两个小问题

1, 出现Error in readRDS(file) : error reading from the co ...

Circos系列教程(四)连线 links 4

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这一节的目标是画出下面的图 所谓连线,就是连接染色体组两个不同位置的线。这是circos的最主要目的及用途之一 ...

Circos系列教程(三)突出标记Highlight 6

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这一节的目标是画出下面的图 所谓突出标记,或者说亮显强调,多是通过大的反差明显或者符合色彩心理学的色块来将数据 ...

Circos系列教程(二)染色体示意图ideograms 30

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本节的目标就是画出如下的图 基础:circos作业流程 定义: The symbolic representa ...