理解edgeR

from: edgeR: a Bioconductor package for differential ex ...

使用DEXSeq分析NGS数据中的exon表达差异 10

对于RNA-seq,除了gene水平的差异分析外,还可以进行exon水平的差异分析。这时可以使用Biocond ...

GATK练习题 14

GATK练习题
因为本教程年代有些久远,无法保证其正确性,只是用于交流讨论。 教程适用于GATK v4, release 2. ...

how to install SortMeRNA on mac os x 10.8.5 2

I download SortMeRNA from http://bioinfo.lifl.fr/RNA/so ...

如何统计BAM文件中的reads数 11

当完成测序的比对工作之后,我们得到了bam/sam文件。那么,如何得到reads的统计数据呢? 这有很多途径: ...

如何让R自动保存历史记录(auto save R history before crash)

也许第一眼看到这个题目,您可能并不认为这是一个问题,因为大家都知道,R会自动在当前工作目录保存名为.Rhist ...

升级Bioconductor至2.13 1

Bioconductor已经升级至2.13了,我们如何升级自己的bioconductor呢? 首先最好是先升级 ...

在R中肩并肩(side-by-side)绘制箱线图(box-plot)

在R中肩并肩(side-by-side)绘制箱线图(box-plot)
这里分为两部分,第一,肩并肩绘制图型,第二,对于有显著差异的相邻的数据标记星号。 > a<-mat ...

R当中的circos——OmicCircos 10

R当中的circos——OmicCircos
R也可以画出类似circos的图了,这是最新的OmicCircos给我们带来的新功能。 OmicCircos与 ...

Bioconductor软件包下载统计

bioconductor有它自己的统计,在http://bioconductor.org/packages/s ...