cbioportal的CGDS-R库使用介绍

substitute() in S4

magrittr – Ceci n’est pas un pipe.

如何使用biomaRt做hg19注释

因为现在ensembl已经更新了human的注释库,所以当你直接使用

library("biomaRt")
database[......]<p class="read-more"><a href="http://qiubio.com/archives/3854">继续阅读</a></p>

R/Bioconductor开发中import和depend的区别

import:将命名空间载入

depends:将命名空间载入,并且放入搜索目录。

两者在使用上的区别是:import只载入对开发者有用的,而depends需要载入对用户有用的。比如说GenomicRanges,
如果你开发的包使用到了GRanges类,并且它会成为结果返回给用户,那么你就必须使用depends了,如果你只是用了GenomicRanges中的类或者函数,比如说GRang[……]

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生物信息学生R入门教程–前言

本教程版权为《糗世界》所有,任何组织或个人不得未经书面许可转载。

本教程主要针对的对象为R/Bioconductor零基础的一线科研人员,生物信息学在读学生,以及想系统学习与掌握Bioconductor的专业信息分析人员。

如果你已经有了一定的R基础,你可以忽略本教程的学习。但是笔者还是建议有R基础的读者有机会反过头来了解一下本教程的内容。

为什么R

R是基于S的脚本式语言[……]

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