how to install SortMeRNA on mac os x 10.8.5 2

I download SortMeRNA from http://bioinfo.lifl.fr/RNA/so ...

R为什么认为它们不相等 3

R为什么认为它们不相等
在最近的编程过程中遇到一个小问题: > floor(29/50*50) [1&# ...

如何使用bioconductor做liftover 2

当我们有不同版本的bed文件,比如说有的bed文件map到hg18, 有的bed文件map到hg19,或者对于 ...

如何统计BAM文件中的reads数 11

当完成测序的比对工作之后,我们得到了bam/sam文件。那么,如何得到reads的统计数据呢? 这有很多途径: ...

使用Bioconductor下载GEO(Gene Expression Omnibus)上的数据 57

本文以GSE46106数据为例,讲述如何从GEO上下载数据。分为两个方面,第一,直接从GEO上下载表达数据,第 ...

Bioconductor并行(parallel)运算

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当我们进入大数据时代之后,并行运算就十分重要了。什么是大数据呢?引用一句流行语吧: Big data is h ...

使用RStudio维护bioconductor软件包

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在使用RStudio之前,需要安装好subversion 下面是安装的list Windows: SilkSV ...

使用pd.genomewidesnp.6为GenomeWideSNP_6做注释

代码如下: > head(dat) Composite.Element.REF Call ...

如何在R中使用超几何分布计算p-value 2

问题,假设有两组ChIP-seq的数据A和B,我想知道它们之间是否相关。A组一共有50个数据,B组一共有60个 ...

如何让R自动保存历史记录(auto save R history before crash)

也许第一眼看到这个题目,您可能并不认为这是一个问题,因为大家都知道,R会自动在当前工作目录保存名为.Rhist ...